Le savoir ne s'acquiert pas seulement dans une salle de classe. Les fondateurs des Maisons Familiales Rurales ont compris dès le départ qu'on apprend aussi dans une situation de travail, auprès des maîtres de stage ou d'apprentissage, auprès des parents, dans l'environnement culturel ou social. A partir de cette réalité, depuis l'origine, les Maisons Familiales appliquent une pédagogie de l'alternance entre :

• - un temps sur le terrain, un temps d'action avec des responsabilités professionnelles,
• - un temps d'études à la Maison Familiale Rurale.

La formation est centrée sur la motivation et l'engagement des jeunes mais également des adultes qui les accompagnent.